Pabarupis je selo u općini okruga Jonava, u okrugu Kaunas, Litva. Pabarupis se nalazi na 63 m nadmorske visine. Najbliži veći grad je Jonava, 15,5 km jugoistočno. Među znamenitostima u okolici su Deveta kula u Kaunasu (29 km), M. K. Čiurlionis National Art Museum (32 km) i Dvorac u Kaunasu (33 km).