Pavyžupys je selo u općini Kalvarija, u okrugu Marijampolė, Litva. Pavyžupys se nalazi na 150 m nadmorske visine. Broj stanovnika je 5. Najbliži veći grad je Marijampolė, 25 km sjeveroistočno. Među znamenitostima u okolici su Puńsk synagogue (16,1 km), Church of the Assumption in Puńsk (16,2 km) i Our Lady of Częstochowa church in Becejły (13,8 km).
Piše se i Pavyžupys.