Pakisys je selo u općini okruga Šilalė, u okrugu Tauragė, Litva. Pakisys se nalazi na 89 m nadmorske visine. Broj stanovnika je 92 (2021). Najbliži veći grad je Tauroggen, 28 km jugoistočno. Među znamenitostima u okolici su Church of the Immaculate Conception, Kvėdarna (11,6 km), Pakisys hillfort (0,7 km) i Church of St. Francis of Assisi, Šilalė (12,0 km). Među prirodnim znamenitostima su Medvėgalis (31 km).

Piše se i Pakisys.