Rapėjai je selo u općini okruga Molėtai, u okrugu Utena, Litva. Rapėjai se nalazi na 162 m nadmorske visine. Najbliži veći grad je Utena, 42 km sjeverno. Među znamenitostima u okolici su Molėtai Astronomical Observatory (23 km), Dubingiai Castle (18,6 km) i Church of St. James the Apostle, Joniškis (7,0 km).
Piše se i Rapėjai.