Stoniškė je selo u općini okruga Trakai, u okrugu Vilnius, Litva. Stoniškė se nalazi na 130 m nadmorske visine. Najbliži veći grad je Alytus, 32 km zapadno. Među znamenitostima u okolici su Dvorac na otoku Trakaiu (33 km), Raižiai Mosque (22 km) i Church of St. Simon and St. Jude Thaddeus the Apostles, Dusmenys (4,0 km).
Piše se i Stoniškė.