Šernupė je selo u općini okruga Ukmergė, u okrugu Vilnius, Litva. Šernupė se nalazi na 81 m nadmorske visine. Najbliži veći grad je Ukmergė, 24 km istočno. Među znamenitostima u okolici su Siesikai Castle (7,4 km), Church of St. Michael the Archangel, Bukonys (10,3 km) i Church of the Discovery of the Holy Cross in Panoteriai (13,3 km).
Piše se i Šernupė.